2065. godine Zemlja je u središtu rata s vanzemaljskim vanzemaljcima zvanim Nova. Oružane snage razvijaju i treniraju Pandore, kćeri koje mogu koristiti posebno genetsko tkivo zvano Stigmata (Seikon) kako bi pokazale nadljudske borbene oružne sustave i vještine. Podržavaju Pandore muškarci partneri zvani Limiteri, koji koriste posebne ovlasti za zamrzavanje kako bi ograničili slobodu svoje konkurencije.
Bilo koji od ovih ograničitelja je Kazuya Aoi, čija je pokojna sestra bila Pandora. Kazuya upoznaje snažnu Pandoru, Satellizer el Bridget, nadimka Nedodirljiva kraljica, zbog njezina bešćutnog stila i krajnje afefobije dok je pohađala West Genetics Academy u Japanu. Unatoč upozorenjima njegovih školskih kolega da se kloni Satellizatora, Kazuya se sprijatelji s njom i traži da joj bude Limiter. Satellizer pristaje na druženje s njim, iako ubrzo pada na natjecanje u ljubavnoj vezi Rana Linchen, koja vjeruje da je Kazuya njezina srodna duša nakon što ju je podržao kroz nekoliko borbi protiv fakultetskih protivnika promjeni položaja i smjerova. Kad Novasi napadnu svoje fakultete koristeći se Pandorama pod njihovom kontrolom kako bi dobili pristup podzemnom laboratoriju institucije, njihova konkurencija se uklanja.
Satellizer i Kazuya pridružuju se nekoliko učenika zapadne genetike u laboratoriju na Aljasci, gdje bi mogli pomagati zajedno sa zadatkom Evolution Pandora (E Pandora), omogućavajući normalnim ženama da transplantacije Stigmata postanu Pandore. Kad jedan od E Pandora poludi, ostali izdaju pitanje jesu li lijekovi u eksperimentiranju opasni, ali natjerani su da udovoljavaju željama poslovne organizacije kao i upravitelju. Otkrivši da će ih, dok ih ne potroše, iskoristiti, E-Pandora Amelia Evans dirigira pobunu koja eskalira u punoj mjeri na Novom sukobu.
Kazuya saznaje više o vezama svoje obitelji s Novom, kao i s Pandorom. Kazuyin djed Gengo Aoi pronašao je isti posao, koji Rana i Satellizer postavlja u jedinstveni tim sa ženama zvanim Valkyries. Ipak, tijekom demonstracijskih aktivnosti s prilagođenom dizajniranom Nova koja je lažna, Pandore doživljavaju zablude, kao i lažne Novase, postaju legija stotine Nova koje uništavaju Genetiku. Gengo se tome suprotstavlja oslobađanjem Legendarnih Pandora koje su tetke Kazuje. Pokušaj Chevaliera da izvrši atentat na Genga zapošljavajući nekoliko osuđenika zvao se Busters, kada se nekoliko legendarnih Pandora presvlači u smrtonosne Novase, ali zadatak se raspada.
