U AG 101 (101. godina kalendara napredne generacije) misteriozni entitet poznat samo pod nazivom „UE“, ili „nepoznati neprijatelj“, napada i uništava svemirsku koloniju Angel. Ovaj brutalni napad postaje zloglasan kao “Dan kad je anđeo pao” i označava početak čovjekova rata za opstanak. Serija započinje u AG 108 kada UE napada svemirsku koloniju Ovan, gdje Flit Asuno sada živi nakon što je pobjegao iz kolonije Angel prije njenog uništenja. Majka Flit, malo prije nego što je UE ubije, daje sinu predmet pod nazivom "AGE Device". Unutar njega otkriva nacrte snažnog oružja iz prošlosti - drevnog mesije zvanog "Gundam".
Iz tih nacrta, Flit provodi sljedećih nekoliko godina proučavajući inženjerstvo u bazi Zemaljske federacije na svemirskoj koloniji Nora i dizajnirajući Gundam AGE-1. Sedam godina kasnije, u AG 115, Flit dovršava Gundam AGE-1 Normal, baš kao što je UE napao Noru, i koristi ga kako bi pomogao posadi federalnog bojnog broda "Diva" u evakuaciji građana kolonije prije nego što bude uništena. Odlučan da dovede bitku na UE zbog dva puta uništavanja svog doma, Flit pristaje služiti u Divinom mobilnom odredu koji pilotira Gundamom. Nakon što su prikupili dovoljno podataka i vojne moći da uspostave pravac djelovanja, posada Dive i njihovi saveznici započeli su uspješan napad koji je uništio tajnu tvrđavu UE u asteroidu Ambat. Tamo doznaju da su UE zapravo potomci navodno neuspjele ljudske misije poslane radi kolonizacije Marsa, kojeg je Zemaljska federacija ostavila mrtve, a koji su na crvenom planetu formirali vlastitu naciju pod nazivom Veigan.
